我国科学家开拓出转录组快速建库新要领 有望助力新型冠状病毒测序

网络 林晓舟 2020-02-01 16:29  阅读量:10538   

 
 
我国科学家开拓出转录组快速建库新要领 有望助力新型冠状病毒测序  
 

新华社北京2月1日电(记者魏梦佳)北京大学与清华大学连系课题组近期在国际权威学术期刊《美国科学院院刊》颁发论文,称开拓出了名为“SHERRY”的转录组测序快速建库新要领。研究团队暗示,这种要领大大简化了建库进程,不只可用于高质量的单细胞转录组测序,对包罗新型冠状病毒等样本的测序质量和速度也有望显著晋升。

核糖核酸(RNA)是存在于生物细胞以及部门病毒、类病毒中的遗传信息载体。今朝,RNA测序技能已遍及应用于绘制物种转录组图谱、研究疾病分子调控机制等偏向。据相识,针对差异研究需求,差异起始量的RNA需回收差异的RNA扩增要领,但今朝常见的扩增要领大多操纵繁复、耗时长。对付微量样本的检测,也存在许多技能挑战。

研究人员发明,被遍及应用于DNA测序建库技能的Tn5转座酶可以直接浸染于RNA/DNA杂交链,从而省去传统RNA建库技能中的扩增等必不行少但繁琐的操纵步调,同时也制止了预扩增进程中所带来的方向性。这种新的基于Tn5转座酶的转录组测序快速建库要领,被定名为“SHERRY”。

据作为课题构成员的北京大学黄岩谊传授和清华大学王建斌研究员先容,尝试功效表白,SHERRY建库质量较好,对碱基序列表示出了较高的平衡率,且操纵流程简朴,整个流程仅需要5个步调,可在一个试管中完成,时间仅约4小时,个中手工操纵时间不到半小时,大大节减了尝试本钱。

课题组专家、北京大学生物医学前沿创新中心主任谢晓亮传授暗示,新要领应用遍及,首个临床应用是对新型冠状病毒传染者的样本举办测序。与现有的RNA测序建库要领对比,“SHERRY”更敏捷、更简朴,这对检测和阐明十分重要。

“我们的团队今朝正在夜以继日、分秒必争地攻关,但愿提供更好的新型冠状病毒的测序要领,处事疫情防控需要。”谢晓亮说。

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