高质量油菜基因组图谱宣布

网络 林晓舟 2020-01-20 00:50  阅读量:14317   

 
 
高质量油菜基因组图谱宣布  
 

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高质量的油菜基因组图谱 供图:华中农大

克日,《自然—植物》在线宣布了8个甘蓝型油菜品种(质料)的高质量参考基因组。华中农业大学作物遗传改善国度重点尝试室油菜团队与生物信息团队以此为基本理会了油菜生态型分化的遗传和分子基本。该研究为进一步理会甘蓝型油菜基因组布局、加快油菜品种改善提供了重要资源,对重要农艺性状基因定位和克隆有重要意义。

油菜是世界第三大油料作物,提供全球13-16%的食用植物油。约7500年前,地中海地域呈现白菜和甘蓝自然杂交发生的甘蓝型油菜。20世纪被引入中国、澳大利亚和北美后,甘蓝型油菜在自然和人工选择下经验了适应性变革并慢慢形成三种差异生态型(冬性油菜、半冬性油菜和春性油菜)。

油菜是异源四倍体作物,具有巨大的基因组,已宣布油菜参考基因组的质量和代表性不敷以满意油菜成果基因组学研究和遗传改善的需求。因此,该研究通过整合数据,对8个代表性甘蓝型油菜的基因组举办了组装和注释。个中,ZS11 Contig N50高出3.1 Mb,是今朝最完整的油菜参考基因组。

为了研究人员更利便地操作多个基因组,该研究以共线性直系同源基因为纽带首次构建了油菜种内索引Gene Index。通过较量基因组学要领,绘制了8个基因组的综合变异图谱,这些变异对油菜至少9.4%的编码基因发生了大效应影响。油菜泛基因组和焦点基因组架构为成果基因研究和遗传育种提供了新的重要资源。

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